Die Regierungspräsidien in Kassel und in Darmstadt sind für die Regierungsbezirke in Nord- bzw. Südhessen verantwortlich. Zusätzlich nimmt jedes Regierungspräsidium bestimmte Aufgaben landesweit wahr.
Die Dienstaufsicht über das Personal der Regierungspräsidien hat das Hessische Ministerium des Innern und für Sport, während die Fachaufsicht beim jeweiligen Fachressort angesiedelt ist.
Dem Regierungspräsidium Gießen unmittelbar nachgeordnete Behörden sind die sechs Hessischen Ämter für Versorgung und Soziales in Darmstadt, Frankfurt, Fulda, Gießen, Kassel und Wiesbaden. Des Weiteren ist das Hessische Landesprüfungs- und Untersuchungsamt im Gesundheitswesen der Dienstaufsicht des Regierungspräsidiums unterstellt.